東京FC與上海綠地申花的歷史交戰記錄主要集中在2017年至2019年的亞冠聯賽中。在2017年，雙方共進行了兩次交手，均在上海進行。2017年3月22日，上海綠地申花主場迎戰東京FC，最終比分為2-1，比賽中，申花采用了4-4-2陣型，由瓜林和莫雷諾搭檔雙前鋒，中場方面由秦升和曹赟定坐鎮，后防線上金洋洋、柏佳駿等人表現出色，門將曾誠發揮穩健。東京FC則以4-3-3陣型出戰，進攻端由奧利維拉和伊涅斯塔領銜。2017年10月18日，東京FC前往上海虹口足球場挑戰上海綠地申花，最終比分為1-2，此役東京FC依舊采取了4-3-3陣型，但申花憑借瓜林和朱建榮的進球贏得了勝利。

2018年，雙方再次在亞冠聯賽中相遇，這一次是在東京進行。2018年4月17日，東京FC主場迎戰上海綠地申花，最終比分為3-1，東京FC采用了4-3-3陣型，進攻端由萊昂德羅和小林悠表現突出，而申花則以4-4-2陣型出戰，由瓜林和莫雷諾擔任雙前鋒。2018年10月16日，上海綠地申花客場挑戰東京FC，最終比分為1-2，申花方面由瓜林打入唯一一球，東京FC則由萊昂德羅和伊涅斯塔分別攻入一球。

2019年，雙方在亞冠聯賽中第三次交手，此次比賽同樣在上海舉行。2019年4月17日，上海綠地申花主場迎戰東京FC，最終比分為2-2，申花方面由瓜林和楊旭各進一球，東京FC則由萊昂德羅和伊涅斯塔聯手為球隊扳平比分。2019年10月15日，東京FC再次來到上海，雙方激戰90分鐘，最終比分為1-1，申花由瓜林打進一球，東京FC則由伊涅斯塔扳平比分。兩隊在比賽中都采用了4-3-3陣型，申花方面，瓜林和莫雷諾繼續擔任雙前鋒，中場由秦升和曹赟定坐鎮；東京FC則由萊昂德羅和伊涅斯塔擔任進攻核心。